Autor:
Tiina Tamm

Eukarüootides toimuva valgusünteesi uurimisgrupp

Uurime kuidas toimib valgusünteesi aparaat eukarüootses rakus. Ribosoom, mis on suur RNA-valk kompleks, tõlgib informatsiooni RNA-s (mRNA) sisalduvat geneetilist informatsiooni valkude keelde. Meie teadusuuringute põhiküsimuseks on: kuidas eukarüootse ribosoomi ülesehitus ehk struktuur määrab ribosoomide funktsiooni.

Sellele küsimusele vastamiseks kasutame erinevaid geneetika, biokeemia ja rakubioloogia meetodeid. Käimasolevate projektide raames keskendume nii ribosoomivalkude kui ka ribosoomi RNA-s olevate keemiliste modifikatsioonide funktsioonide uurimisele. Ribosoomivalkudest on meie fookuses eukarüootidele omased valgud, mis on olulised ribosoomi subühikute vaheliste kontaktide ehk sildade moodustamisel. Ribosoomi RNA olevatest paljudest modifikatsioonidest uurime just neid, mis paiknevad ribosoomi funktsionaalsetes keskustes ja subühikute vahelises alas.

Kasutame pagaripärmi tüvesid, mis sisaldavad mutantseid ribosoome. Selgitame välja kuidas mutantsed ribosoomivalgud või RNA modifikatsioonide puudumine mõjutab valgusünteesi erinevaid etappe, valgusünteesi kiirust ja täpsust ning mRNA-s olevate elementide äratundmist ribosoomide poolt (näiteks ülesvoolu asuvad avatud lugemisraamid, IRES elemendid, programmeeritud raaminihke signaalid). Uurime, kuidas mutantsete ribosoomidega rakud taluvad erinevaid stressitingimusi ja kuidas muutub nendes rakkudes sünteesitud valkude muster.

 

Kisly I, Tamm T. (2023) Archaea/eukaryote-specific ribosomal proteins - guardians of a complex structure. Comput Struct Biotechnol J. 21:1249-1261. doi: 10.1016/j.csbj.2023.01.037

Kisly, I., Kattel, C., Remme, J. Tamm, T. (2021) Luciferase-based reporter system for in vitro evaluation of elongation rate and processivity of ribosomes. Nucleic Acids Res. 49(10):e59. doi: 10.1093/nar/gkab121

Tamm T, Kisly I, Remme J. (2019) Functional Interactions of Ribosomal Intersubunit Bridges in Saccharomyces cerevisiae. Genetics 213(4):1329-1339. doi: 10.1534/genetics.119.302777

Kisly I, Remme J, Tamm T. (2019) Ribosomal protein eL24, involved in two intersubunit bridges, stimulates translation initiation and elongation. Nucleic Acids Res. 47(1):406-420. doi: 10.1093/nar/gky1083

Novaator: Tartu Ülikooli teadlased tegid elu alusprotsesse uurides tähtsa avastuse

Kuku raadio:Teadus teab

Kuku raadio: Kuue samba taga. Mida uurivad molekulaarbioloogid ning kuidas nende töö aitab ravimitootjaid ja veinitegijaid? Saatekülaline on molekulaar- ja rakubioloogia instituudi professor Tiina Tamm.

Novaator: Gümnasistid tegid koos teadlastega kindlaks Eestis kasvavad pärmseened

taimesein

Sel nädalavahetusel toimub 50. teoreetilise bioloogia kevadkool

MR (fookus all) LT-Tulf-202 (Mariana Tulf)

Teenused ettevõtetele ja teadlastele

Tartu Ülikooli peahoone

Algab ülikooli uue arengukava koostamine